上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海创业投资有限公司、中科院上海生命科学研究院等十一家在上海的国内知名大学、研究院、医院和企业共同组建而成。2003年2月，国家发展与改革委员会批准上海生物芯片有限公司负责建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”。